Avant 2002, en Allemagne la régulation de l'industrie financière était entreprise par 3 agences séparées. En mai 2002, la BaFin a été établie, suivant le passage de la Loi des Services Financiers et d'Intégration. Le but de cette Loi et de la fusion des 3 agences était de créer un régulateur financier intégré qui aurait pu couvrir tous les marchés financiers. Les agences qui étaient fusionnées ensemble étaient le Bureau Fédéral de la Supervision Bancaire, le Bureau Fédéral de la Supervision pour le Trading Bouriser et le Bureau Fédéral de la Supervision d'Assurance. La BaFin a été donnée la responsabilité supplémentaire suivant le passage de la Loi Bancaire en 2003 avec le but de l'augmentation de la protection des clients et du développement de la réputation du système financier allemand. Les autres pouvoirs y compris la surveillance de la solvabilité des établissements financiers et la collection de leurs informations en détail. Cette zone particulière de responsabilité était partagée avec la Bundesbank. Actuellement, la BaFin éprouve une sorte de transition, comme la responsabilité pour la supervision bancaire est reprise par la Banque Centrale Européenne.